Uniunea Europeană a suspendat subvenţiile acordate Republicii Cehe prin programul Phare, din cauza disfuncţionalităţilor apărute în sistemul ceh de aprobare a proiectelor finanţate prin acest program. Ministrul ceh al finanţelor, Radek Zeman, susţine că problemele au apărut ca urmare a trecerii la un nou sistem de acceptare a proiectelor finanţate prin programul Phare, numit EDIS. Comisia Europeană a anunţat că cerinţele EDIS trebuie îndeplinite pe deplin pentru ca ţările ce au devenit membre ale UE în acest an să poată primi finanţare în continuare. Se pare, însă, că Cehia nu este singurul stat membru al UE care a întîmpinat dificultăţi în implementarea sistemului EDIS.
Radek Zeman este pregătit să poarte discuţii cu reprezentanţii Comisiei Europene pentru rezolvarea problemelor. Zeman afirmă că acestea trebuie soluţionate în trei-patru luni. Ministrul ceh al finanţelor nu a reuşit să estimeze volumul exact al subvenţiilor care vor ajunge cu întîrziere la benficiari (prin programul Phare), însă afirmă că este vorba de zeci de milioane de euro. În plus, Zeman susţine că toate contractele pentru finanţări Phare încheiate înainte de 4 august 2004 sînt valide, iar fondurile alocate vor fi plătite la timp.
Republica Cehă a primit de la Uniunea Europeană, începînd cu anul 1990, peste 35 de miliarde de coroane (1,1 miliarde de euro) prin programul Phare. Fondurile au fost destinate, în principal, proiectelor de mediu, transport şi afaceri.