CFR a contestat, în luna august 2011, raportul Curţii de Conturi pe 2010 cu privire la cheltuielile legate de reabilitarea căii ferate Bucureşti - Constanţa, potrivit unui comunicat de presă al companiei. Compania feroviară susţine că, în perioada verificării, organele de control au fost informate că nicio achiziţie finanţată din împrumutul încheiat cu Banca Japoneză pentru Cooperare Internaţională (JBIC) pentru reabilitarea tronsonului Bucureşti - Constanţa nu s-ar fi putut face fără respectarea procedurilor de achiziţii ale JBIC. Procedurile ODA prevăd utilizarea obligatorie de acreditive pentru plăţi la contracte, acreditive care sunt confirmate şi de împrumutat, respectiv Ministerul Finanţelor Publice. Astfel, reprezentanţii CFR susţin că procedurile au fost respectate, iar cele 10,65 milioane de euro din împrumut, pentru achiziţia a 18 maşini de cale ferată destinate întreţinerii căii, au fost cheltuite legal. De asemenea, o altă sumă aflată în raportul Curţii ca prejudiciu, 2,91 milioane de euro, a fost cheltuită legal pentru plata unor cheltuieli destinate consultantului şi experţilor, susţin reprezentanţii CFR.
Trei companii de stat din domeniul transporturilor au produs prejudicii de peste 200 de milioane de lei la bugetul naţional, potrivit raportului pe 2010 al Curţii de Conturi, citat de Agerpres. În urma controlului efectuat de Curtea de Conturi la CFR şi la sucursalele acesteia s-au constatat nereguli în ceea ce priveşte gestionarea bunurilor din domeniul public şi privat al statului. Prejudiciul este de 212 milioane de lei, conform raportului public al Curţii pe anul 2010, iar printre neregulile constatate la CFR se numără realizarea unor plăţi ilegale, erori contabile şi o serie de achiziţii fără justificare. De asemenea, raportul arată şi nereguli în valoare de 7,6 milioane de lei sesizate la Compania Naţională de Autostrăzi şi Drumuri Naţionale din România, dar şi la direcţiile regionale de drumuri şi poduri. De asemenea, Curtea de Conturi a constatat prejudicii şi la TAROM, de aproximativ un milion de lei. Din aceasta sumă, circa 682.000 de lei au fost erori sau abateri contabile, po-trivit raportului Curţii de Conturi.